La faune de Pandora est très importante, à la fois fascinante et dangereuse. La plupart des êtres vivants de Pandora sont des hexapodes, c'est à dire qu'ils possèdent 6 membres, excepté les Na'vis, les humanoïdes de cette planète. La Na'vis mesurent entre 2,70m et 3m. Les Nav'is du clan des Omaticaya (ceux mis en scène dans le film) habitent dans un gigantesque arbre appelé : Kelutral. Leur déesse nommée Eywa est elle aussi un arbre.
Equidius est mastodonde à 6 pattes que les Na'vis chevauchent pour chasser. Ils utilisent aussi les Ikrans (Banshees) pour chasser dans les airs. Mais un chasseur devient parfois une proie en présence du Grand Leonopterix. Dans la canopée (étage supérieur de la forêt en contact direct avec l'atmosphère libre) rôdent d'autres prédateurs : les Loups Vipérins, le Titanosaure-marteau à carapace et le plus redoutable, Thanator.
Flore
Une extraordinaire variéter de plantes prospère sur la planète. La nature de Pandora évolue et communique tels un système nerveux, ce qui impliquerait un lien symbiotique entre tout ce qui vit.
La beauté à sa place parmis des choses effrayantes. De vastes champs magnétiques utilisant les propriétés de l'unobtanium permettent aux montagnes Hallelujah de flotter dans le Flux, constamment en mouvement. L'unobtanium est le meilleur de tous les supraconducteurs. Sa rareté explique la présence des humains sur Pandora. L'unobtanium se vend $20 millions le kilogramme. Sa valeur est contrebalancée par le coût de l'extraction, très élevé en raison des conditions dangereuses sur Pandora.
Les facteurs environnementaux auxquels sont soumises les plantes sur la Terre - radiation, eau, gaz atmosphérique et pesanteur - sont également présents sur Pandora, bien que les caractéristiques diffèrent profondément, comme le montre la singularité de la flore. L'atmosphère sur Pandora est plus dense que sur la Terre, avec une concentration en dioxyde de carbone plus élevée, auquel s'ajoutent du sulfite d'hydrogène et du Xénon.
Pandora évolue dans le système Alpha Centauri à 4,4 années lumière de la Terre. Alpha Centauri est le système stellaire le plus proche de nous. Le soleil qui éclaire Pandora se nomme Alpha Centauri A (ACA). Pandora est la cinquième lune de Polyphemus, une planète gazeuse légèrement plus petite que Saturne et a quatorze lunes. L'atmosphère de Pandora est toxique pour les humains. Une partie de la surface de Pandora est recouverte par une gigantesque fôret tropicale.
Tout organisme vivant sur Pandora a des propriétés bioluminescentes qui font resplendir la nuit. La bioluminescence est produite par réaction chimique au sein d'organismes indigènes et parfois émanant des corps d'organismes vivant à l'intérieur d'eux. La bioluminescence de Pandora est suffisamment puissante pour qu'elle soit visible par une navette spatiale en orbite.
Selon les scientifiques, la nature de Pandora évolue et communique tels un système nerveux, ce qui impliquerait un lien symbiotique entre tout ce qui vit. La meilleure illustration de ce lien ce sont peut-être les Woodsprites, les graines d'Utraya Mokri : l'Arbre des Âmes. Un arbre sacré pour les Na'vis. Ils croient qu'il relie intimement toutes les formes de vie.
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